文章出處:技術支持|閱讀量:2724|發表時間:2021-11-05
高通量測序實驗室又稱NGS實驗室,以高通量測序技術為主要檢測手段,完成臨床疾病篩查或輔助診斷等項目。對于NGS實驗室的設計,要參考《分子病理診斷實驗室建設指南(試行)》、《個體化醫學檢測質量保證指南》、《腫瘤個體化治療檢測技術指南》、《個體化醫學檢測實驗室管理辦法》、《測序技術的個體化醫學檢測應用技術指南(試行)》進行、《高通量測序技術臨床規范化應用北京專家共識(腫瘤部分)》、《國家衛生計生委關于印發醫學檢驗實驗室基本標準和管理規范(試行)的通知》等相關規范。>>>商務洽談,點此處,在線咨詢
NGS實驗室的區域設置原則上需要滿足《醫療機構臨床基因擴增檢驗實驗室工作導則》的要求,在不影響檢測質量的前提下,分區可依據實際情況適當合并。對潔凈環境來說,因為NGS項目檢測中腫瘤診斷與治療的要求最為嚴格,所以NGS的實驗室相對常規PCR實驗室來說,要求更高。
一般我們根據常規NGS操作步驟,NGS實驗室大致可分為以下區域:
(1)試劑儲存和準備區;
(2)樣本前處理區;
(3)樣本制備區;
(4)文庫制備區;
(5)雜交捕獲區/多重PCR區域(第一擴增區):
(6)純化一區;
(7)文庫擴增區(第二擴增區);
(8)純化二區;
(9)測序區;
(10)潔凈走廊及污染走廊區域。
腫瘤NGS診斷實驗室平臺主要區域及流轉示意圖
NGS實驗室分區的要求目前在業內存在一定爭議,有專家認為分區設置必要性不大且浪費空間,考慮到目前不同層級實驗室的管理能力差異較大,為方便實驗室進行質量管理,確保檢測質量,NGS實驗室建議根據擬開展的檢測項目數量、檢測技術流程、測序平臺和工作量大小來制定分區設計的方案。建議實驗室至少設置五個功能區:試劑存儲和準備區、標本與文庫制備區、文庫擴增與檢測區、測序區、數據分析與存儲區。各區域的功能和相關要求如下。用于測序數據的分析與存儲。數據應進行安全備份,并與互聯網物理隔離。規定原始序列核心數據的保存期限。詳細說明并記錄數據存儲路徑。應說明數據庫是否為云端存儲以及數據庫更新的程序和管理要求。
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